Библиотека Рефераты Курсовые Дипломы Поиск
Библиотека Рефераты Курсовые Дипломы Поиск
сделать стартовой добавить в избранное
Кефирный гриб на сайте www.za4et.net.ru

Биология Биология

Изучение трехмерной структуры с помощью рентгеновской дифракции и реконструкции изображения

Крючки с поводками Mikado SSH Fudo "SB Chinu", №4BN, поводок 0,22 мм.
Качественные Японские крючки с лопаткой. Крючки с поводками – готовы к ловле. Высшего качества, исключительно острые японские крючки,
58 руб
Раздел: Размер от №1 до №10
Карабин, 6x60 мм.
Размеры: 6x60 мм. Материал: металл. Упаковка: блистер.
44 руб
Раздел: Карабины для ошейников и поводков
Пакеты с замком "Extra зиплок" (гриппер), комплект 100 штук (150x200 мм).
Быстрозакрывающиеся пакеты с замком "зиплок" предназначены для упаковки мелких предметов, фотографий, медицинских препаратов и
148 руб
Раздел: Гермоупаковка

Содержание 1. Кристаллизация мембранных белков 2. Реконструкция изображения и двумерные кристаллы 2.1 Реконструкция изображения 2.2 Три примера структурных исследований мембранных белков 3. Структура фотосинтетических реакционных центров f . viridis и f . sphaeroides 3.1 Вывернутый белок 3.2 Расположение спиралей в бислое и их соединение 4. Структура поринов 1. Кристаллизация мембранных белковНаиболее детальную структурную информацию об очищенных мембранных белках можно получить, исследуя методом рентгеновской дифракции трехмерные белковые кристаллы. К сожалению, оказалось, что интегральные мембранные белки очень трудно кристаллизовать. Будучи удалены из своего естественного липидного окружения, неполярные участки липидных молекул склонны агрегировать с образованием неупорядоченных форм, непригодных для кристаллографического анализа. Ясно, что необходимы специальные методы, позволяющие обойти эти трудности, и в этом был достигнут определенный прогресс. Михель обратил внимание, что мембранные белки образуют кристаллы двух типов. Кристаллы типа I напоминают стопки мембран. В них осуществляется латеральное взаимодействие между неполярными участками, а мембраноподобные слои связывают полярные участки белков. Подобные кристаллы были получены для нескольких белков, но ни в одном случае их нельзя было исследовать с помощью дифракции с высоким разрешением. Кристаллы типа II стабилизируются за счет контактирования полярных участков белковых молекул, а небольшие амфифильные соединения или детергенты в основном заполняют промежутки между ними. Заметим, что очень важными являются размер, заряд и другие свойства детергентов; если эти параметры неблагоприятны, то детергент может дестабилизировать кристаллическую структуру. Кристаллы типа II образуют белки фотосинтетического реакционного центра Rhodopseudomo as viridis. Имеются данные, что близка к завершению работа по установлению структуры матриксного порина с высоким разрешением из наружной мембраны Е. coli. Итак, мембранные белки можно кристаллизовать, и хотя число Успешных попыток пока невелико, можно сделать несколько выводов, касающихся методологии кристаллизации. 1. Белки кристаллизуются вместе с детергентом. 2. Очень важен выбор детергента. По-видимому, наиболее при- годны цвиттерионные или неионные детергенты с высокой ККМ и Малым размером мицелл.Таблица 1. Мембранные белки, которые были закристаллизованы Белок Ссылки 1. Реакционный центр R. viridis &quo ; 2. Реакционный центр R. sphaeroides &quo ; 3. Реакционный центр фотосистемы 1 циаиобактерий Phormidium lami osum 4. OmpF 5. OmpA &quo ; 6. LamB 7. Бактериородопсин Кристаллизация облегчается в присутствии малых амфифиль-ных органических молекул, по-видимому влияющих на полярные концевые группы детергента. Так, белок реакционного центра R. viridis удалось закристаллизовать в присутствии 1,2,3-гептантриола. Полиэтиленгликоль и сульфат аммония, обычно использующиеся при кристаллизации растворимых белков, применялись и для индукции кристаллизации мембранных белков. В работе отмечалось, что условия кристаллизации в некоторых случаях близки к условиям, при которых детергент образует отдельную фазу.

Роль, которую играет агрегация детергента в процессе кристаллизации белково-детергентных комицелл, неизвестна, но очевидно, что правильный выбор детергента очень важен. 2. Реконструкция изображения и двумерные кристаллыТрехмерные кристаллы мембранных белков получить очень трудно, но многие из них образуют двумерные упорядоченные структуры. В некоторых случаях белки формируют такие структуры i vivo,. При подходя-&quo ; щих условиях такие белки, как и многие другие, образуют &quo ;двумер-' ные кристаллы&quo ; при их очистке и реконструкции в присутствии фос-фолипидов. Подобные двумерные упорядоченные структуры можно, использовать для получения трехмерной структурной информации с, помощью электронной микроскопии и методов реконструкции изображения. 2.1 Реконструкция изображенияЭта методика исходно предназначалась для изучения вирусных частиц, а к мембранным белкам она была впервые применена Хендерсоном и Ануином, исследовавшими бактериородопсин. В принципе этот метод позволяет получить структурную информацию, достаточную для того, чтобы проследить ход полипептидной цепи, но реализовать эту возможность пока не удалось. Рассеяние электронов достаточно велико для того, чтобы визуализировать отдельные молекулы с помощью электронного микроскопа. Однако интенсивность пучка электронов, необходимая для этого, слишком велика, сам образец при этом разрушается, и для получения высокого разрешения приходится использовать гораздо меньшие интенсивности. В обычной трансмиссионной электронной микроскопии для усиления контраста используется негативное контрастирование, но оно непригодно для выявления структурных деталей тех участков белка, которые погружены в бислой, поскольку они недоступны для красителя. Красители редко используются для реконструкции изображения; исключение составляют лишь исследования по визуализации водных каналов. Чтобы получить достаточную информацию с помощью пучка электронов низкой интенсивности, необходимо просуммировать изображения многих молекул. Именно с этой целью используют двумерные упорядоченные структуры. Сами изображения представляют собой двумерные проекции электронной плотности образца. Проведя оцифровку этих изображений и применив преобразование Фурье, можно выявить повторяющиеся элементы и устранить шумы. Еще раз применив преобразование Фурье к этим повторяющимся элементам, реконструируют исходное изображение, но уже без шумов. В основе процедуры лежит удачный прием, позволяющий суммировать изображения, полученные от сотен и тысяч молекул в поле зрения микроскопа. Проекции электронной плотности в двух направлениях недостаточны для построения трехмерной структуры. Поэтому, наклоняя образец, получают проекции образца под разными углами и используют их для реконструкции трехмерного изображения объекта. Таким образом строят карту электронной плотности в мембране на Разных уровнях. Обычно приводят данные о профиле электронной плотности через каждые 15-25 А.Таблица 2. Мембранные белки, структуру которых определяли методом реконструкции изображения Белок Трехмерное разрешение, А Ссылки 1. APH: убихинон оксидоредуктаза (митохондрии) 13 2.

Цитохром с-оксидаза (митохондрии) 20 3. Убихинол-цитохром с - оксидоредуктаза (митохондрии) 25 4. Свет ос обирающий комплекс, содержащий 16 В табл.2 представлен список белков, которые были изучены этим методом. Во всех случаях, кроме бактериородопсина, уровень разрешения был достаточен только для очерчивания общих контуров молекул и определения их размеров. Однако даже такая информация может быть очень ценной. Например, выяснилось, что многие из этих молекул в двумерных кристаллах существуют в виде отдельных мультимеров, а порин и бактериородопсин являются тримерами. В случае порина существует четко наблюдаемый канал, в образовании которого на внешней поверхности клетки участвует каждый из трех отдельных полипептидов; сливаясь, эти полипептиды образуют одиночный канал на периплазматической поверхности наружной мембраны Е. coli. Коннексин выглядит как гексамер, а ацетилхолиновый рецептор - как симметричный пентамер. Ферменты дыхательной цепи митохондрий, убихинолцитохром с-оксидоредуктаза и цитохромоксидаза, являются димерами, хотя неясно, существуют ли эти димеры i vivo. Удивительно, как сильно белки иногда выступают над поверхностью бислоя. Например, отдельные части цитохром с-оксидазы возвышаются над поверхностью бислоя на 50 А 1314, 466] ; такая же картина наблюдается для ацетилхолинового рецептора. Напротив, порин и бактериородопсин почти не выдаются над поверхностью мембран. На рис.3.3 представлена структура цитохром с-оксидазы, полученная с низким разрешением. 2.2 Три примера структурных исследований мембранных белковРассмотрим три примера изучения интегральных мембранных белков, иллюстрирующие большое разнообразие используемых для этого методов. Наиболее известными структурами являются реакционные центры R. viridis и R. sphaeroides, исследование которых с помощью рентгеновской дифракции было весьма успешным. Еще одна наиболее полно изученная структура - бактериородопсин Н. halobium; для его исследования применялся метод реконструкции изображения, а также другие подходы. Порин и родственные белки наружной мембраны Е. соЧ изучали в основном с помощью генетических и молекулярно-биологических методов, позволяющих идентифицировать функционально важные участки. 3. Структура фотосинтетических реакционных центров f . viridis и f . sphaeroidesФотосинтетические реакционные центры представляют собой комплексы белков с пигментами; в них происходит первичное разделение зарядов в фотосинтетических мембранах. Лучше всего охарактеризованы комплексы из пурпурных несерных бактерий; они обычно состоят из трех белковых субъединиц - Н, М и L. Реакционный центр Rhodopseudomo as viridis имеет также четвертую субъединицу - цитохром с-типа. Простетическими группами этого комплекса являются четыре гемогруппы, четыре бактериохлорофилла Ь, два бактериофеофитина, одно негемовое железо, один менахинон и один убихинон. Под действием света электрон переходит от первичного донора электронов, так называемой &quo ;специальной пары&quo ; - молекул бактериохлорофилла, образующих димер, к бактериофеофитину, а затем к первичному хиноновому акцептору QA.

РЕНТАБЕЛЬНОСТЬ (от немецкого rentabel — доходный, прибыльный), показатель экономической эффективности производства на предприятиях, в отраслях и народном хозяйстве в целом. Рассчитывается как отношение прибыли к сумме производственных основных фондов и оборотных средств либо к себестоимости продукции. РЕНТГЕН, смотри в статье Доза излучения. РЕНТГЕНОВСКИЙ СТРУКТУРНЫЙ АНАЛИЗ, исследование атомной структуры образца вещества по картине дифракции на нем рентгеновского излучения. Позволяет установить распределение электронной плотности вещества, по которому определяют род атомов и их взаимное расположение. С помощью рентгеновского структурного анализа исследуют структуру кристаллов, жидкостей, белковых молекул и др. Основы рентгеновского структурного анализа заложены в работах немецкого физика М. Лауэ в 1912, английских физиков У.Л. и У.Г. Брэггов и российского ученого Г.В. Вульфа в 1913. РЕНТГЕНОВСКОЕ ИЗЛУЧЕНИЕ, не видимое глазом электромагнитное излучение с длиной волны 10-5 — 102 нм. Открыто В.К. Рентгеном в 1895

1. Трехмерная структура носителей власти. Система отношений носителей власти в политической психологии

2. Разработка обучающей программы, поддерживающей изучение темы "Структуры данных"

3. Изучение поверхности полупроводника с помощью сканирующего электронного микроскопа

4. Изучение мезоскопических сверхпроводящих структур

5. Методические приемы по систематизации и обобщению знаний при изучении структуры биополимеров в школьном курсе химии

6. Демография как объект изучения, ее место среди наук, структура, основные понятия и подходы
7. Изучение принципов организации арифметико-логическиз устройств. Структура алу для умнлжения чисел с фиксированной запятой
8. Создание и обработка изображений с помощью графического редактора растровой графики Adobe Photoshop

9. Изучение основных технологических процессов, состава и структуры фондов строительной организации

10. Изучение динамики вращательного движения с помощью маятника Максвелла

11. Логический анализ E-структур с помощью графов

12. Введение в специальность («комплексная реконструкция и эксплуатация зданий и сооружений»)

13. Проблемы изучения космоса

14. Эволюция, образование и структура Вселенной

15. Анализ устойчивости и поддержание орбитальной структуры космической системы связи

16. Изучение миксомицетов среднего Урала, выращенных методом влажных камер

Набор детской складной мебели Ника "Фиксики. Азбука".
Это безопасная, удобная мебель, которая компактно складывается и экономит пространство Вашей квартиры. Углы стола и стула мягко
1451 руб
Раздел: Наборы детской мебели
Набор цветных карандашей Stilnovo, 24 цвета.
Гексагональные цветные деревянные карандаши с серебряным нанесением по ребру грани. Есть место для нанесения имени. Яркие модные цвета.
448 руб
Раздел: 13-24 цвета
Учимся читать по слогам. 40 карточек-пазлов. Митченко Ю.
В наборе 40 двухсторонних карточек-пазлов, разработанных для детей, которые уже знакомы с алфавитом. Эта развивающая игра поможет ребенку
389 руб
Раздел: Алфавит, азбука

17. МЕТОДЫ ИЗУЧЕНИЯ ЭВОЛЮЦИИ ЧЕЛОВЕКА

18. Синапсы (строение, структура, функции)

19. Статистика населения. Методы анализа динамики и численности и структуры населения

20. История изучения и использования природных вод на Урале

21. Определения положения объектов на местности при помощи приборов нивелира и теодолита

22. Аппарат государственной власти и его структура
23. От безвозмездной помощи СССР двум йеменским государствам к равноправному сотрудничеству России и единого Йемена
24. Памятники права в историческом изучении

25. М.М.Богословский и его методология по изучению истории России

26. Структура органов власти в США по конституции 1787 года

27. Международная организация труда- создание, структура, задачи и организация её работы

28. Структура закона Саратовской области "О местном самоуправлении в Саратовской области". Полномочия органов местного самоуправления в области жилищного хозяйства, коммунально-бытового и торгового обслуживания населения

29. Структура, содержание и значение общей части Налогового кодекса России

30. Налоги, их состав и структура

31. Понятие права и правовой нормы. Виды и структура правовой нормы. Понятие и виды юридической ответственности

32. Понятие, структура и методики построения страховых тарифов

Подушка детская Dream Time.
Детская подушка: стеганный чехол (наполнитель бамбуковое волокно 150 г/м2, ткань 100% хлопок - сатин). Наполнитель: полое сверхтонкое
775 руб
Раздел: Подушки для детей
Набор карандашей чернографитных "1500", 24 штуки, заточенные, металлический пенал.
Карандаш Koh-I-Noor с обозначением "1500" — это самый известный графитный карандаш в мире. Профессиональные, высококачественные
662 руб
Раздел: Чернографитные
Настольная игра "Гонки ежиков".
Топот ножек и азартное сопение целый день не утихают на лесной полянке. В этой игре для всей семьи игроки управляют ёжиками с помощью
605 руб
Раздел: Классические игры

33. Структура правовых норм

34. Структура правоотношения. Классификация правоотношений: критерии и виды

35. Теоретические аспекты между бюджетами всех уровней с помощью деятельности Федерального Казначейства

36. Использование интегрированных курсов при изучении иностранного языка

37. Социокультурный компонент содержания обучения как средство повышения мотивации изучения иностранных языков на среднем этапе общеобразовательной школы

38. Эффективные методы изучения иностранных языков
39. "Хлопки, хлопушки, удары" в народном танце, методика изучения
40. Культура, её структура и функции

41. Структура и организация учебного процесса в средневековом университете (Болонья, Париж, Прага)

42. Памятники саргатской культуры как источник для реконструкции социально-экономических отношений и мировоззрения населения

43. И.И.Крылов на Кавказских Минеральных Водах. Изучение проблемы

44. Судьба деревни в изображении современных писателей (В. Распутин "Прощание с Матёрой", А. Солженицын "Матрёнин двор")

45. "Горечь" и "сладость" человеческой жизни в изображении И.Бунина и А.Куприна

46. Загальна структура мовної системи

47. Историческое изображение эпохи начала XIX века в произведении А.С.Пушкина "Евгений Онегин"

48. Особенности художественного изображения эпохи Ивана Грозного в творчестве А. К. Толстого

Глобус Земли политический, диаметр 420 мм.
Политический глобус Земли. Диаметр: 420 мм. Масштаб: 1:30000000. Материал подставки: пластик. Цвет подставки: прозрачный. Цвет дуги может
1981 руб
Раздел: Глобусы
Магическая кружка-мешалка, черная.
Оригинальная кружка с двойными металлическими стенками (нержавеющая сталь). Сохраняет напиток горячим в течение дольшего времени (в
554 руб
Раздел: Кружки
Кружка фарфоровая "Olympia", 300 мл.
Кружка фарфоровая "Olympia", украшенная золотой обводкой, станет достойным дополнением к вашей коллекции посуды для чаепития. Объём: 300 мл.
304 руб
Раздел: Кружки

49. Русская деревня в изображении В.П. Астафьева

50. Трансформация жанровой структуры литературы Древнего Египта

51. Структура ораторской речи

52. К вопросу о методологии изучения жизни и творчества М.Ю. Лермонтова

53. Изображение русского национального характера в произведениях Н.С. Лескова и И.А. Гончарова

54. Военная и экономическая помощь СССР Китаю в годы японо-китайской войны 1937–1945
55. Основные компоненты систем управления документооборотом. Фрейм: его структура и понятие
56. Интернет: административное устройство и структура глобальной сети

57. Глобальные гипертекстовые структуры: WWW

58. Реконструкция волоконно-оптической линии связи

59. Как играть в игры с помощью модэма

60. Структура персонального компьютера. Основные и периферийные устройства, их характеристики и назначение

61. Передача информации из компьютерного рентгеновского томографа TOMOSCAN SR7000

62. Разработка алгоритмов и программ выполнения операций над последовательными и связанными представлениями структур данных

63. Анализ структур, характеристик и архитектур 32-разрядных микропроцессоров

64. Структура и реализация макроязыков

Шкатулка для ювелирных украшений, 13x13x6 см, арт. 84412.
Шкатулка сохранит ваши ювелирные изделия в первозданном виде. С ней вы сможете внести в интерьер частичку элегантности. Регулярно удалять
832 руб
Раздел: Шкатулки для украшений
Комплект постельного белья 1,5-спальный "Самойловский текстиль. Настроение", с наволочками 50х70.
Постельное белье "Самойловский текстиль" – отличный подарок себе и близким. Качественное, удобное и красивое постельное белье
1249 руб
Раздел: Бязь
Бумага чертежная, А2, 594x420 мм, 100 листов.
Плотность: 200 г/м2, ГОСТ 597-73.
1687 руб
Раздел: Папки для акварелей, рисования

65. Построение реалистичных изображений предметов сервировки стола (стакана, фужера, рюмки, заполненных напитками) ([Курсовая])

66. Программа сложной структуры с использованием меню

67. Помощь в обучении программированию

68. Семантический анализ структуры EXE файла и дисассемблер (с примерами и исходниками), вирусология

69. Моделирование структуры книги

70. Пример создания БД "Материалы" с помощью Access
71. Структура и программирование ПЛИС фирмы Altera в САПР Quartus II, её применение в лабораторном стенде
72. Финансовый контроль и планирование с помощью Excel

73. Трехмерное параметрическое моделирование на персональном компьютере

74. Обзор ситуации с внедрением автоматизированных банковских систем в финансовых структурах России

75. Обработка табличной информации с помощью сводных таблиц средствами MicroSoft Excel

76. "Семейный бюджет" (расчет с помощью программы Microsoft Excel 97)

77. Слои изображения в программе Photoshop

78. Программ-игра «Морской бой», с использованием анимированных графических объектов и возможностью управлять их движением с помощью клавиатуры

79. Создание баннеров с помощью программы Adobe PhotoShop 7.0

80. Структура сходящихся последовательностей

Этикетки самоклеящиеся "ProMEGA Label", А4, 1 штука, 25 листов, белые.
Этикетки самоклеящиеся для печати на лазерных, струйных принтерах и копировальных аппаратах. При хранении листы с этикетками не слипаются
330 руб
Раздел: Бейджи, держатели, этикетки
Настольная игра "Кролики и норы".
Издавна настольные игры, в частности, настольные игры на ловкость, были в мире очень популярным народным развлечением. Все вместе люди
612 руб
Раздел: Игры на ловкость
Моющее дезинфицирующее средство "Ника-Экстра М", 1 л.
Средство для очищения и мытья поверхностей в помещениях, жесткой мебели, санитарно-технического оборудования, предстерилизационной очистки
364 руб
Раздел: Для сантехники

81. Приближенное вычисление определенного интеграла при помощи квадратурной формулы Чебышева

82. Управление структурой преподавательского состава в университете

83. Структура исчисления предикатов построение логического вывода

84. Дневник по скорой помощи

85. Ученые, внесшие вклад в лечение и изучение сердечно сосудистой системы

86. Оказание первой медицинской помощи при автомобильных катастрофах
87. Лечение и реабилитация инвалидов с помощью верховой езды
88. Дневник практики на подстанции скорой помощи

89. Неотложная помощь при тяжелых инфекциях

90. Кровотечения, их классификация и первая медицинская помощь при них

91. Оказание первой помощи

92. Средства визуализации изображений в компьютерной томографии и цифровых рентгенографических системах

93. История скорой помощи

94. Кровотечения. Первая медицинская помощь

95. Преступность и методика ее изучения

96. Структура арбитражных судов

Двусторонние клеевые подушечки UHU Fix, 50 штук.
Двухсторонние клеящие подушечки с высокой клеящей способностью для постоянного крепления. Позволяют прикрепить практически любой нетяжелый
350 руб
Раздел: Универсальный
Сетка москитная на кроватку "Карапуз", размер М.
По всему краю данное изделие имеет резинку. Закрывает кроватку полностью, сверху и по бокам. Для кроватки 120х60 см. Сезон: лето.
385 руб
Раздел: Сетки противомоскитные
Тетрадь на резинке "Study Up", А5, 120 листов, клетка, розовая.
Тетрадь общая на резинке. Формат: А5. Количество листов: 120 в клетку. Бумага: офсет. Цвет обложки: розовый.
360 руб
Раздел: Прочие

97. Взяточничество и коррупция в деятельности преступных структур (сообществ)

98. Федеральная служба Российской Федерации по контролю за оборотом наркотических средств и психотропных веществ: система и структура, основные полномочия

99. Изучение и разработка очистки стоков от ионов тяжелых металлов (Доклад)


Поиск Рефератов на сайте za4eti.ru Вы студент, и у Вас нет времени на выполнение письменных работ (рефератов, курсовых и дипломов)? Мы сможем Вам в этом помочь. Возможно, Вам подойдет что-то из ПЕРЕЧНЯ ПРЕДМЕТОВ И ДИСЦИПЛИН, ПО КОТОРЫМ ВЫПОЛНЯЮТСЯ РЕФЕРАТЫ, КУРСОВЫЕ И ДИПЛОМНЫЕ РАБОТЫ. 
Вы можете поискать нужную Вам работу в КОЛЛЕКЦИИ ГОТОВЫХ РЕФЕРАТОВ, КУРСОВЫХ И ДИПЛОМНЫХ РАБОТ, выполненных преподавателями московских ВУЗов за период более чем 10-летней работы. Эти работы Вы можете бесплатно СКАЧАТЬ.