Библиотека Рефераты Курсовые Дипломы Поиск
Библиотека Рефераты Курсовые Дипломы Поиск
сделать стартовой добавить в избранное
Кефирный гриб на сайте www.za4et.net.ru

Биология Биология

Построение 3D-моделей циклических молекул в естественных переменных

Карабин, 6x60 мм.
Размеры: 6x60 мм. Материал: металл. Упаковка: блистер.
44 руб
Раздел: Карабины для ошейников и поводков
Ночник-проектор "Звездное небо, планеты", черный.
Оригинальный светильник-ночник-проектор. Корпус поворачивается от руки. Источник света: 1) Лампочка (от карманных фанариков); 2) Три
350 руб
Раздел: Ночники
Мыло металлическое "Ликвидатор".
Мыло для рук «Ликвидатор» уничтожает стойкие и трудно выводимые запахи за счёт особой реакции металла с вызывающими их элементами.
197 руб
Раздел: Ванная

Е.Г. Атавин, Омский государственный университет, кафедра органической химии 1. Введение Интерес к геометрическому строению циклических молекул, интенсивно изучаемых как экспериментальными, так и расчетными методами, определяется не только их важнейшей ролью в органической химии и биохимии, но также сложностью и практически неисчерпаемым количеством соответствующих конформационных вариантов, особенно в случае гетероциклических соединений. Для построения модели (т.е. вычисления 3 декартовых координат) -атомной молекулы в общем случае достаточно задать 3 -6 значений структурных параметров - межъядерных расстояний, валентных углов и углов внутреннего вращения, называющихся также внутренними или естественными переменными и легко оценивающихся по имеющимся эмпирическим закономерностям . Оставшиеся 6 степеней свободы связаны с выбором положения и ориентацией молекулы в пространстве. Тем не менее, число структурных параметров, описывающих строение -атомных моноциклических молекул, равно 3 ( межъядерных расстояний, валентных углов и углов внутреннего вращения). Из этих параметров лишь 3 -6 являются независимыми, и их значения можно выбирать произвольно (в пределах условия замыкания цикла). Оставшиеся 6 параметров называются зависимыми и определяются значениями независимых параметров. Отметим, что пространственное строение нециклических молекул полностью описывается заданием значений -1 межъядерных расстояний, -2 валентных углов и -3 углов внутреннего вращения. Замыкание цепи атомов в цикл увеличивает на единицу количество независимых межъядерных расстояний. При этом количество независимых угловых переменных уменьшается и становится недостаточным для непосредственного использования ранее рассмотренных алгоритмов построения нециклических молекул . Алгоритмы построения циклических молекул по естественным переменным можно разделить на две группы. Для итерационных методов (методы "стягивающего потенциала" и Шераги) характерна слабая чувствительность к качеству стартового приближения значений структурных параметров. Однако низкое быстродействие делает их малоэффективными при решении задач, требующих многократного построения модели молекулы (решение обратной задачи при поиске структурных параметров в дифракционных методах исследования, уточнение геометрии в методах молекулярной механики и квантовой химии, конформационный поиск и т.д.). Алгоритмы построения геометрической модели молекулы неитерационными методами (метод Нордландера) опираются на вспомогательные геометрические построения, отличаются способом выбора 3 -6 назависимых параметров из общего их количества, работают значительно быстрее методов первой группы, однако требуют аккуратного выбора значений независимых геометрических параметров, не противоречащих условию замыкания цикла. При сравнении алгоритмов полезно иметь в виду, что точность задания структурных параметров на основании эмпирических закономерностей существенно падает в ряду "межъядерные расстояния", "валентные углы", "торсионные углы", и включение в число зависимых параметров максимального количества торсионных углов является предпочтительным.

2. Метод "стягивающего потенциала" Очевидно, что линейная цепь атомов может быть неотличима от циклической, если подобрать соответствующие значения геометрических параметров. Подбор осуществляется итерационно, так, чтобы расстояние между концами линейной цепочки атомов постепенно приближалось к длине соответствующей химической связи. Для этого к обычному минимизируемому функционалу прибавляется так называемый "стягивающий потенциал", исчезающи по мере приближения расстояния между концами цепи к эталонному значению. 3. Метод Шераги Авторам удалось включить в набор независимых структурных параметров все межъядерных расстояний и валентных углов. Теперь лишь -6 углов внутреннего вращения требуется задавать во входных данных. Оставшиеся шесть зависимых торсионных углов должны удовлетворять системе из шести уравнений, формулирующих условия замыкания цикла, сводящейся к уравнению с весьма громоздкими коэффициентами, решаемому итерационно. 4. Метод Нордландера Строится линейная цепь из -1 атома. Если расстояние между концами этой цепи не превышают суммы длин двух оставшихся связей, то замыкание легко обеспечивается достраиванием последнего атома между этими концами. Метод формально неитерационный, но обеспечить отмеченное требование к стартовому набору структурных параметров практически невозможно без итерационного подбора. Набор независимых параметров содержит межъядерных расстояний, -2 валентных угла и -4 угла внутреннего вращения. 5. Метод построения пространственных моделей циклических молекул Недостатки предыдущего метода в конечном итоге вытекают из неудачного выбора замыкающего (одноатомного) фрагмента, предопределяющего жесткие требования к расстоянию между концами основной цепи. В предлагаемом методе роль замыкающего фрагмента играет цепочка, равная примерно половине длины строящегося цикла. Значительно больший диапазон возможных значений расстояний между ее концами, с учетом сопоставимости длин обеих цепочек, обеспечивает построение цикла практически при любых разумных вариациях стартового набора структурных параметров с помощью следующей схемы: 1. Разбиваем цикл на две примерно одинаковые по длине цепи (основную и рабочую), состоящие из M и L атомов соответственно (M L = 2). Строим обе цепочки с помощью одного из алгоритмов построения нециклических молекул , обеспечивая их ориентацию относительно оси OX в соответствии с рис. 1а. б. 2. Вычисляем расстояния (R1 и R2) между концами цепей. 3. Поворотом правой ветви рабочей цепи вокруг оси OX на угол добиваемся, чтобы расстояния между концами цепей совпали. Это возможно при двух значениях угла  (1 и 2): 1 = Arcsi (C/) - Arcsi (B/), 2 =  - Arcsi (C/) - Arcsi (B/), где  = Sig (A) sqr (A2 B2) A = y1 zm - z1 ym B = y1 ym z1 zm C = (R22 - R21) / 2 B. Рис. 1. Ориентация основной (а) и рабочей (б) цепей. Знак параметра A совпадает со знаком вспомогательного торсионного угла F1,J,J 1,M . В случае, если в исходной цепи четыре атома 1,J,J 1,M попадают в плоскость (то есть F = 0,p), параметр A обращается в ноль.

При этом y1 = -y2. Однако при смене знака параметра A решения скачком меняются местами. При этом малые изменения структурных параметров приведут к большим изменениям геометрии молекулы, в частности, возможен самопроизвольный переход от одного оптического размера к другому. Анализ показывает, что избежать зависимости результата от выбора стартового приближения и обеспечить непрерывное изменение геометрии можно, если выбирать окончательное решение следующим образом: f = { y1, если sg 1 Sig (A) > 0 y2, если sg 1 Sig (A) &l ; 0 Параметр sg 1 введен для управлением выбором нужного решения. Значение sg 1 = 1 приводит к конформации цикла, наиболее близкой к стартовой в том смысле, что вспомогательный торсионный угол F при построении цикла не будет менять знак. Значение sg 1 = -1 изменит знак F и приведет к конформеру, отвечающему тому же набору независимых параметров, но с другими значениями зависимых параметров. В случае abs(C/r) > 1 построение цикла с заданным набором параметров невозможно, поскольку значение R1 не попадает в интервал изменения расстояния R2. Для корректировки вводимых значений структурных параметров полезно иметь в виду, что если C &l ; 0, то R1 > Rmax, а если C > 0, то R1 &l ; Rmi . 4. Цепочки соединяются концами (рис. 2). Рис. 2. Замыкание цикла. 5. Цикл перегибается по линии соединения до придания независимому валентному углу a 21 заданного значения. Соответствующий угол f 21M может быть вычислен по формулам пункта (3), если в качестве параметров R1 и R2 взять легко вычисляемое конечное и исходное значения межъядерного расстояния R2, . При этом также возникает два варианта решения, для выбора из которых необходимо ввести второй знаковый параметр sg 2. Если заданный угол a несовместим с условием замыкания цикла (при этом abs(C/r) > 1), то его следует увеличить, если C > 0, или уменьшить, если C &l ; 0. Пошаговый перебор значений независимых торсионных углов для всех четырех комбинаций знаковых параметров sg 1 и sg 2 позволит получить полный набор конформеров исследуемой циклической системы. Отметим также, что, в отличие от предыдущего метода, содержащего два зависимых валентных угла, предлагаемый алгоритм использует лишь один зависимый валентный угол M-1,M,M 1. Следовательно, в наборе независимых параметров содержится на один труднооцениваемый торсионный угол меньше. Это уменьшает на единицу размерность пространства перебора структур и значительно ускоряет конформационный поиск. Предлагаемый алгоритм формально применим к карбо- и гетероциклам, начиная с пятичленного, однако его достоинства (быстродействие и работоспособность в относительно широком диапазоне заданных значений независимых параметров) в наибольшей степени проявляются для макроциклических систем. Список литературы Mas ryukov V.S., Simo se S.H. Empirical correla io s i s ruc ural chemis ry // Molecular S ruc ure Research 1996. V.2. P.163-189. Атавин Е.Г., Тихоненко В.О. Построение 3D-моделей нециклических молекул в естественных переменных // Вестник Омского университета. 1998. №2. С.35-37. Дашевский В.Г. Конформационный анализ органических молекул.

Очень сомнительно, однако, что Конгресс позволит вооруженным силам бездействовать, в то время как противник будет атаковать Гавайи, Панаму, Аляску. Поэтому новые авианосцы придется вводить в бой "по мере готовности" – с очевидным результатом. В любом случае потеря Мидуэя ставит США перед реальной перспективой затяжной и очень дорогостоящей войны, которая даже в случае конечной победы дорого обойдется американской экономике. Можно ли быть уверенным в том, что деловые круги страны не окажут на правительство давление в пользу компромиссного мира на приемлемых условиях? Геополитика Тихоокеанской войны 1941-1945 гг. До продажи Аляски весь регион находился в полном распоряжении России, что обеспечивало стране идеальные стартовые условия в предстоящей борьбе за Тихий океан, правда, лишь при наличии достаточной транспортной связности района с европейской Россией. После утраты «Русской Америки» в Беринговом море возник стратегический баланс, который благополучно пережил все мировые войны и просуществовал до распада СССР: две симметричные базы, расположенные всего в 1.250 милях друг от друга, то есть в масштабах Тихого океана очень близко, – Петропавловск и Датч-Харбор – нейтрализовывали друг друга Великая война на Тихом океане интересна во многих отношениях: она иллюстрирует устойчивость геополитических задач, прочность установившихся позиций, диалектику морской/воздушной и сухопутной войны, логику борьбу за связность, блеск и нищету стратегии, построенной на модели «естественных границ», неумолимость «транспортной теоремы»

1. Построение verilog-модели ber-тестера для проверки каналов связи телекоммуникационных систем

2. Развитие логического мышления младших школьников при обучении построению вспомогательных моделей в процессе решения текстовых задач

3. Построение экономической модели с использованием симплекс-метода

4. Построение экономической модели c использованием симплекс-метода

5. Построение геологической модели и прогнозного разреза

6. 3D-модель и сборочный чертёж с применением SolidWorks планки МТМ80-3100030СБ
7. Построение параметрической модели детали в среде программирования
8. Построение эконометрической модели

9. Построение регрессионной модели

10. Построение информационной и даталогической моделей данных

11. Овладение методикой построения экономико-математических моделей, решение конкретных задач по стратегическому планированию и прогнозированию

12. К построению качественной регрессионной модели этнической идентичности

13. Построение циклических кодов

14. Построение и использование компьютерных моделей

15. Построение модели ИС

16. Построение модели бизнес-плана парикмахерской с помощью имитационной модели

Бальзам для волос "Natura Siberica" Легкое расчесывание, 250 мл.
Детский бальзам для волос "Natura Siberica" бережно ухаживает за волосами, не спутывая их. Специальная формула бальзама помогает
330 руб
Раздел: Экстракты, сборы
Набор деревянных кукол.
Игрушка способствует развитию логики, моторики и творческих способностей ребенка. В наборе 6 кукол: мама и папа, мальчик и девочка,
1031 руб
Раздел: Классические куклы
Детские подгузники-трусики "Nepia. Genki!" (для мальчиков и девочек), 13-25 кг (размер XXL), 18.
Подгузник изготовлен по последним технологиям из невероятно мягкого материала, идеально фиксируется, обеспечивая комфорт и надежную
703 руб
Раздел: Обычные

17. Основные принципы построения автоблокировки переменного тока

18. Кинетика замедленной флуоресценции органических молекул в н.-парафинах при 77 к и ее математическая модель

19. Построение моделей развития России. Направления ее реформирования

20. Построение и анализ однофакторной эконометрической модели

21. Построение моделей статики по методике активного эксперимента

22. Вселенная, которую я выбираю (Модель Вселенной Лео Шарка)
23. Стационарная модель Вселенной
24. Луна - естественный спутник Земли

25. Лекции по естественной географии

26. Особенности Японской модели экономики

27. Социально-экономическая модель в Швеции: процесс становления и развития

28. Методы и модели демографических процессов

29. Принцип построения налога на добавленную стоимость

30. Математические методы и модели в конституционно-правовом исследовании

31. Анализ современных моделей реформирования налоговой системы

32. Словообразовательные модели неологизмов в современном английском языке

8 цветных смывающихся фломастеров для малышей.
336 руб
Раздел: 7-12 цветов
Универсальная вкладка для дорожных горшков (мятный).
Вкладка для дорожных горшков подойдет для любого дорожного горшка, она хорошо ложится на сиденье, обеспечивая комфорт и удобство в
664 руб
Раздел: Горшки обычные
Игрушка-прорезыватель силиконовый Happy Baby "Silicone teether".
Особенности: фактурная поверхность массирует дёсны; проникает в труднодоступные места ротовой полости; развивает мелкую моторику; шумовой
559 руб
Раздел: Силиконовые

33. Естественная и гуманитарная культуры. Научный метод

34. Модели будущего в русской литературе

35. Развитие науки: революция или эволюция? Философские модели постпозитивизма

36. Основные черты античной модели

37. Основные положения консервативной модели общественного развития России

38. Проектирование и разработка сетевых броузеров на основе теоретико-графовых моделей
39. Построение локальной компьютерной сети масштаба малого предприятия на основе сетевой ОС Linux
40. Построение сети передачи данных

41. Сетевой уровень построения сетей. Адресация в IP сетях. Протокол IP

42. Телекоммуникационные компьютерные сети: эволюция и основные принципы построения

43. Модемы: назначение, сравнительный анализ моделей, принцип работы, эксплуатация на примере конкретной модели

44. Возможности графических карт. 3D графика

45. Взаимодействия с ЭВМ на естественном языке

46. Комплекс программ построения справочников по формальным языкам

47. Состав и функционирование ИС построенной по принципу "клиент-сервер" для численного обоснования решений

48. Циклические алгоритмы

Соковарка ВЕ-08/1 "Webber", 8 л.
Кастрюля для воды: 24х11,5 см; 5 л. Контейнер для фруктов: 26х16см; 8 л. Контейнер для сока с силиконовой трубкой: 26х16 см; 8 л. Толщина
2673 руб
Раздел: Скороварки, пароварки, мантоварки
Набор посуды "Тролли", 3 предмета.
Набор посуды в подарочной упаковке. Кружка 210 мл. Миска 18 см. Тарелка 19 см.
521 руб
Раздел: Наборы для кормления
Муфта для коляски Bambola (шерстяной мех + плащевка + кнопки), темно-синяя.
Муфта на ручку коляски очень легко одевается и защищает Ваши руки от холода. Ткань муфты водоотталкивающая, она утеплена мехом и небольшим
489 руб
Раздел: Муфты на ручку

49. Построение функции предшествования по заданной КС-грамматике

50. Fox Pro - реляционная модель данных

51. ПОСТРОЕНИЕ ДИАГРАММ СРЕДСТВАМИ WORD И EXCEL

52. Разработка управляющей части автомата для сложения двух чисел с плавающей запятой в дополнительном коде с помощью модели Мура

53. Экстремумы функций многих переменных

54. Стохастическая диффузионная модель гетерогенных популяций
55. Построение графика функции различными методами (самостоятельная работа учащихся)
56. Интеграл по комплексной переменной. Операционное исчисление и некоторые его приложения

57. Решение задач на построение сечений многогранников

58. Естественное вскармливание

59. Макрофаги перитонеального экссудата как модель фагоцитоза и нарушений фагоцитарной активности

60. Принцип построения и опыт практической реализации экологических информационных систем

61. Основополагающие принципы андрагогической модели обучения: Оптимальные условия их применения

62. Педагогические модели образования

63. Оценка систем дистанционного образования (математическая модель)

64. Электропривод и автоматизация главного привода специального вальцетокарного станка модели IK 825 Ф2

Подушка для автокресел, детская "Roxy" от 1 до 3 лет.
Детские подушки-рогалики обеспечивают комфортный сон в автомобильном путешествии. Удобная форма рогалика поддерживает шею и не позволяет
391 руб
Раздел: Дорожные пледы, подушки
Магнитные истории "Мир вокруг".
Детская магнитная игра "Мир вокруг" поможет в большом кругу друзей весело провести время. Она заключается в следующем – ребенку
499 руб
Раздел: Игры на магнитах
Карандаши цветные "Kores", 24 цвета, с точилкой.
Цветные карандаши имеют насыщенные цвета. Шестигранная форма корпуса снижает усталость и придает дополнительный комфорт. Мягкий грифель.
396 руб
Раздел: 13-24 цвета

65. Расчет электроприводов постоянного и переменного тока

66. Генераторы переменного тока

67. Построение характеристик непрерывных САУ

68. Модель теплового состояния аппарата сепарации

69. Изучение построения робототехнических комплексов для нанесения лакокрасочных материалов в мебельной промышленности

70. Практика построения логистических систем
71. Проектирование восьмиосной цистерны модели 15-1500
72. Типология К.Г. Юнга и модель информационного метаболизма аушры аугистинавичюте

73. Анализ операций умножения и деления в конкретной модели АЛУ

74. Разработка и исследование имитационной модели разветвленной СМО (системы массового обслуживания) в среде VB5

75. Моделирование как метод естествознания. Модель демографического взрыва

76. Социальная модель Дойча - взгляд каббалиста

77. Методы и модели демографического прогнозирования

78. МОДЕЛЬ ЯДРА АТОМА И ТАБЛИЦА ЭЛЕМЕНТОВ

79. Влияние вращательного и поступательного движения молекул на теплоёмкость многоатомных газов

80. Математические модели естествознания

Подставка для ножей овальная AK-211ST "Alpenkok", 16x6,5x22 см.
Размеры: 16x6,5x22 см. Материал корпуса: пластик. Внутренняя часть: цветное полипропиленовое волокно. Цвет: зеленый. Предназначена для
723 руб
Раздел: Подставки для ножей
Комплект детского постельного белья в кроватку "Амели" (цвет: вишневый/белый).
Комплекты детского постельного белья AmaroBaby выполнены из натурального и гипоаллергенного материала, мягкого и приятного на ощупь.
2825 руб
Раздел: Комплекты в кроватку
Автомобиль-каталка "Премиум-2".
Большой автомобиль-каталка может не только катать малыша, но и перевозить "грузы". Особенно пригодится он в песочнице, где так
1461 руб
Раздел: Каталки

81. "Молекулы мистики" и трансцендентация ЭГО: утрата и обретение целостности бытия

82. Проблемы построения искусственного интеллекта

83. Циклическая концепция цивилизации в философии А. Тойнби

84. Сравнительный анализ моделей обратимого электрорастворения серебра с поверхности твердого электрода (Доклад)

85. Дипольный момент молекулы и связи

86. МОДЕЛЬ ЯДРА АТОМА И ТАБЛИЦА ЭЛЕМЕНТОВ
87. Базовая модель Модильяни – Миллера
88. Зависимость национального дохода от капитальных затрат. Модель Леонтьева

89. Модели рекламного воздействия

90. Концепция построения системы управления Московского представительства японской корпорации

91. ТИПЫ ОРГАНИЗАЦИЙ, ПОСТРОЕНИЕ ОРГАНИЗАЦИИ

92. Японская модель управления на рубеже ХХI века: традиционное и современное

93. Разработка стратегической модели на МП "Вельский хлебозавод"

94. Методология CCM (Capability Maturity Model for Software) – модель развития способности организации разрабатывать и сопровождать программные продукты) в менеджменте качества проектов

95. Исследование особенностей японской модели менеджмента

96. Модель разработки стратегии для ОАО "Аливария"

Точилка Berlingo механическая "Яблоко".
Оригинальная механическая точилка в форме яблока. С одним отверстием для заточки карандашей. Лезвие из высококачественной стали. Механизм
352 руб
Раздел: Точилки
Гидромассажная ванночка для ног (арт. ATH-6411 blue).
Характеристики: - Расслабляющий и оздоровительный массаж. - Мощный компрессор для водно-пузырькового массажа. - 3 сменные насадки. -
1368 руб
Раздел: Прочее
Корзина для белья "Виолетта" (30 литров).
Корзина для белья решит проблему хранения большого количества грязного белья. Благодаря своей прямоугольной форме она может быть легко
396 руб
Раздел: Корзины для белья

97. Регулирование естественных монополий

98. Современные модели управление образовательно-воспитательными учреждениями. Модели управления учреждениями (шпаргалка)

99. Японская модель экономики


Поиск Рефератов на сайте za4eti.ru Вы студент, и у Вас нет времени на выполнение письменных работ (рефератов, курсовых и дипломов)? Мы сможем Вам в этом помочь. Возможно, Вам подойдет что-то из ПЕРЕЧНЯ ПРЕДМЕТОВ И ДИСЦИПЛИН, ПО КОТОРЫМ ВЫПОЛНЯЮТСЯ РЕФЕРАТЫ, КУРСОВЫЕ И ДИПЛОМНЫЕ РАБОТЫ. 
Вы можете поискать нужную Вам работу в КОЛЛЕКЦИИ ГОТОВЫХ РЕФЕРАТОВ, КУРСОВЫХ И ДИПЛОМНЫХ РАБОТ, выполненных преподавателями московских ВУЗов за период более чем 10-летней работы. Эти работы Вы можете бесплатно СКАЧАТЬ.